各部下设各司、各处、各科等。
在内阁外，又设立单独的‘都察院’，‘大法院’。又都察院掌管监察事务，大法院负责审判事务。
施行最基本的行政权、监督权、司法权的相互独立。
在军事上，林哲设立‘最高统帅部’，由皇帝亲自担任最高军事统帅，统帅部下设：联合参谋部、军政部、军训部、军械部、军需部、后勤部、海军部、铨叙司、军医司、总务司等机构。
其中的联合参谋部负责海陆两军作战、演习指挥事宜。
军政部负责陆军日常行政事务。
军训部负责陆军募兵、训练、军校等事务。
军械部负责装备研发，采购等事务。
军需部负责陆军粮食、被服等军需物品采购、营房建设等事务。
后勤部负责陆军后勤运输事务。
上述诸多机构里，相当多部门都是只负责陆军事务，至于海军方面，除了作战指挥权被联合参谋部掌控、将领任免权被铨叙司掌控外，其余权力都归属海军部管辖。
之所以没有简单设立陆军部、海军部，这是因为目前余胜军的主体就是陆军，海军只有几千人而已，相当弱小。
为了避免某个大将掌控陆军大权，林哲干脆是把陆军的诸多部门直接分拆，然后置于统帅部直辖，这样虽然会造成行政效率的下降，但是和防止某个陆军将领坐大一比，不值一提。
上述中央各机构和古制有极大差别外，地方政府机构也是变动极大，随着唯一的一个省级官员，也就是浙江巡抚毕余同被重新委任为总理大臣后，导致中华帝国里已经没有省级官员。
同时考虑到目前中华帝国的控制区还很小，所以虽然有巡抚这个级别，但是暂时不设江苏巡抚和浙江巡抚，而是临时采用中央直辖分巡道的模式。
至于各道则是沿用前清的各兵备道、分巡道，统一称为某某道，比如杭嘉湖道、苏松太道、常州、镇江和江宁三府合为常镇江道。
道以下依旧设各府，州，县等。
但是这表面官职虽然变动不大，但是林哲却是要求各地地方官府重新制定各部门，要求效仿中央设立各机构，以最基本的县来说，要求设立各科，比如民政科、工商科、教育科等。
同时为了巩固中央财权，收回了地方政府的征税权力，命令所有厘金、征税、海关等税收统一由中央财政部征收、拨用，地方官府不得以任何名义私下征税。
由于王朝草创，所以很多制度暂时只能算是一个纸面计划，而整个王朝政权的运行，实际上依旧按照之前的大元帅府时期的模式在进行，要整个改变，则是不少的时间。
称帝建制后，林哲大肆封赏群臣，封出去的爵位普遍偏低，这是因为王朝初立，后期肯定还有在此封赏有功文臣武将的，所以得给以后的封赏留下余地，不然的话现在就封出几个王去，以后还怎么封啊，难不成要把皇帝头衔封出去？
所以首批只封了伯爵三人，分别为徐言青，林安飞，施清瑄。另外又封子爵七人，包括毕余同、沈驰云、石琅翼等人。又封男爵二十三人。
上述爵位皆可减等世袭，也就是说如果你被封为伯爵，等你死了后，嫡长子可以袭次为子爵，儿子死了，后嫡长孙再承袭男爵，男爵最为最低等的爵位，减无可减所以男爵死后嫡长子不可承袭爵位，而是直接削除爵位。
当然，这说的只是最坏的情况，如果家族后代有立功的话，也有可能再晋升爵位。
同时受封的王侯贵族是没有封地的，只能每年领取固定的年薪，除了礼仪上的一些优待外，没有其他的任何政治特权。
除了这些功臣外，按照王朝管理，林哲还得赐予自己的家人、亲戚之类的一些头衔。
比如说他给去年九月才出生，现在连不会走路说话的长女赐予‘淑纯公主’，又给其他乱七八糟的亲戚封了几个贵族，以男爵、子爵居多，而且都是非世袭的头衔。
至于儿子，林哲还没呢，去年的时候陈静怀孕生产，只生了个女儿，当时还没人觉得有什么，因为那时候还没举旗造反呢，没几个人关心林哲的后代问题。
但是等到了现在，一大堆人就是关心起林哲的后代问题来，甚至很多人都是打起了给林哲塞进几十几百个女人的主意。
林哲倒是没有坚持反对，叫嚷着什么一夫一妻制，如果遇上瞧对眼的，他也不介意收为妃嫔，但是他可不愿意随便接受别人送过来的女人。
登基大典，改官职，大肆封赏等，上海这边热闹沸腾！
不过在这种热闹的背后，余胜军的诸多已经受封的高级将领却是悄然离开了上海，奔赴各自的防区。
而随同他们一起离开的，还有大量的军火物资等！
就连刚登基为帝的林哲也没和当年的洪秀全一样，称帝后就待在皇宫里享乐，林哲在登基半月后，就是再一次匆匆踏上征途，带着第一步兵师以及尚未完全成军，只编成了七千余人的第五步兵师奔赴前线。
而这些都表明，余胜军的下一波大规模军事行动即将展开！
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