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计算机辅助药物设计方法(CADD)是药物分子设计的基础,它已经发展成为一门完善和新兴的研究领域,大大提高了药物开发的效率,为人们攻克一些顽症提供了崭新的思路和成功的希望。

它是依据生物化学,酶学,分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶,受体,离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征,设计出合理的药物分子。

假以时日,药物设计会进入一个新的发展时期,人类古老的梦想——理论设计好所需物质然后再进行合成的时代正在成为现实!

而在药物合成工艺中,逆合成分析法,是有机合成路线设计的最基本,最常用的方法。

逆合成分析法的突出特征是逆向逻辑思维,从复杂的目标分子推导出简单的起始原料的思维过程,与化学合成的实际过程刚好相反,因此被称为“逆”合成,或“反”合成。

当代有机合成化学大师、哈佛大学E. J. Corey教授于上世纪60年代正式提出了逆合成分析法。而这位正是陈以清在哈佛读博士时候的导师。

逆合成分析的过程可以简单地概括为:以目标分子的结构剖析为基础,将切断,确定合成子,寻找合成等价物三个步骤反复进行,直到找出合适的起始原料。

掌握的化学反应方面的知识越全面,合成路线的设计思路就越开阔。

在设计药物合成工艺路线时,通常希望路线尽量简捷,以最少的反应步骤完成药物分子的构建。但这不能以牺牲药物的质量为代价,必须确保药物的纯度。

这就要求设计者对反应的选择性有充分了解,尽量使用高选择性反应,减少副产物的生成,以获取高质量的产物。

幸运的是,这三位博士都有着丰富的经验,全面渊博的知识,有了现成的药物分子,逆向推导合成方法并不算太难。

一个月后,新的药物终于在实验室里合成了出来。

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